L'assortiment de musées proposé à Cottbus est très varié et couvre, outre les domaines de l'art et de la culture, les thèmes de la nature, de la médicine et de l'ethnologie.Musée de la ville
Le « Stadtmuseum » (Musée de la ville) a succédé au « Cottbuser Heimatmuseum » et présente l'histoire et la culture de la ville et de ses environs. Plusieurs fois par an, des expositions spéciales sont consacrées à des thèmes d'intérêt particulier. Le bâtiment du Musée de la ville abrite également les archives de la ville Cottbus.Musée de la pharmacie du Brandebourg
Situé directement sur l’ancienne place du marché, le « Brandenburgisches
Apothekermuseum » (Musée de la pharmacie du Brandebourg) est aménagé dans le bâtiment de la pharmacie Löwenapotheke, vieille de 400 ans. Des installations complètes de pharmacie datant de l'époque autour de 1830 et de la première moitié du XXe siècle y sont exposées. Trois officines entièrement reconstituées font la fierté du musée, qui, outre une collection retraçant l'histoire de la pharmacie, présente également des récipients, des instruments et des ouvrages.